Selon d'autres versions du mythe, ces divinités ont été produites par la copulation d'Atoum avec sa propre ombre. Shu et Tefnut ont laissé Atum sur la pierre de Benben pour construire le reste du monde. Après un certain temps, Atum aurait été préoccupé par ses enfants.
Il a enlevé son œil et l'a envoyé à leur recherche. Shu et Tefnut revinrent avec l'œil de leur père, et le dieu pleura de joie quand il vit ses enfants. Ces larmes qui sont tombées sur la pierre de Benben sur laquelle Atum se tenait sont devenues des êtres humains.
La pierre de Benben aurait également été une relique sacrée qui était auparavant conservée dans le « hwt benben », qui se traduit par « Maison du Benben ». Cette précieuse relique a été trouvée dans le sanctuaire le plus profond du temple d'Héliopolis, où Atum était auparavant son dieu principal.
L'objet culte original aurait disparu à un moment donné de l'histoire. Malgré cela, il a été proposé qu'il s'agissait d'une pierre verticale avec un sommet arrondi basé sur des preuves visuelles. Il a également été souligné que plus tard, d'autres temples solaires auraient également leurs propres pierres de Benben.